1、福建省软科学研究重点项目《福建省科技年度报告》，项目主持人，2002-2003。
2、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2003）》，项目主持人，2004。
3、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2004）》，项目主持人，2004-2005。
4、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2005）》，项目主持人，2005-2006。
5、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2006）》，项目主持人，2006。
6、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2007）》，项目主持人，2007。
7、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2008）》，项目主持人，2008。
8、福建省科技厅项目《福建省十一五建设创新型省份中期评估报告》，项目主持人，2008。
9、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2009）》，项目主持人，2009。
10、福建省科技厅项目《福建科技发展60年》，项目主持人，2009。
11、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2010）》，项目主持人，2010。
12、中国科学技术协会项目《促进海峡两岸科普资源交流与发展的机制研究》，并列主持人，2009-2010。
13、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2011）》，项目主持人，2011。
14、福州大学科技发展基金课题《基于平衡计分卡方法的建设资源节约型社会评价体系研究》，项目主持人，2006-2007。
15、福建省软科学研究重点项目《福建科技发展报告（2012）》，项目主持人，2012。
16、福建省软科学研究重点项目《福建省科技创新能力的监测与评价（2013）》，项目主持人，2014。
17、福建省软科学研究重点项目《福建省科技创新能力的监测与评价（2014）》，项目主持人，2015。
18、福建省软科学研究重点项目《福建省科技创新能力的监测与评价（2015）》，项目主持人，2016。
19、福建省科协委托项目《海峡两岸科技产业园区发展模式比较研究》，项目主持人，2013。
20、福建省科技厅项目《福建高新技术产业统计分类目录方案的研究》，项目主持人，2014-2015。
21、中国科协项目《台湾智库的现状及其对两岸关系发展影响的研究》，2014。
22、福建省软科学研究重点项目《改革开放40年福建省科技创新政策沿革与构建科技开放格局的启示》，项目主持人，2019。
23、福建省科委软科学重点课题《古田县2000年科技、经济、社会总体协调发展规划》，课题组主要成员，1990-1991。
24、福建省科委软科学重点课题《加速福建山区建设，促进山海协调发展的战略研究》，排名第三，1994-1995。
25、福建省软科学研究“九五”重大项目《福建省实施“科教兴省”战略的监测与评估研究》，排名第三，2000-2001。
26、福建省委组织部、省科技厅课题《福建省科技人才队伍建设研究》，排名第三，2003。
27、福建省星火计划重点项目《入世后福建农业产业结构调整技术支撑对策研究》，课题组主要成员，2002-2003。
28、福建省软科学研究重大项目《台湾海峡两岸协同促进科技、教育创新的研究》，排名第二，2002-2004。
29、福建省“十一五”规划前期研究课题《福建省“十一五”期间实施人才强省战略问题研究》，排名第二，2004。
30、省社科规划项目课题《福建省县域经济发展与提高县域经济竞争力研究》，2003-2004，排名第二。
31、福建省中长期科技发展规划战略研究专题项目《深化科技体制改革研究》，排名第三，2005。
32、马尾开发区科技局课题《马尾开发区“十一五”科技发展规划》，课题组主要成员，2004-2005。
33、福建省发改委课题《福建省“十一五“人才发展专项规划》，课题组主要成员，2005-2006。
34、福建省科技厅重点课题《依靠科技进步，推进海峡西岸经济区建设的研究》，排名第二，2005。
35、福建省委调研项目《增强福建省自主创新能力的研究》，执笔人排名第二，2005-2006。
36、福建省社会科学规划重点项目《体现先行先试，深化闽台合作》，课题组主要成员，2008。
37、国家自然科学基金项目《双前沿面数据包络分析的理论、方法及应用研究》，排名第四，2008-2010。
38、福建省科学技术协会重大项目《福建科普资源共建共享课题研究》，课题组主要成员，2009-2010。
39、国家自然科学基金项目《原始性创新的路径、方法与实证研究》，排名第二，2011-2013。

主持的科研项目成果《福建科技发展报告（2006）》获2007年福建省优秀软科学研究成果三等奖；参与的项目《福建省实施‘科教兴省’战略的监测与评估研究》获2003年福建省第五届社会科学优秀成果二等奖，《加速福建山区建设，促进山海协调发展的战略研究》获1998年福建省第三届社会科学优秀成果三等奖，《福建省‘十一五’期间实施人才强省战略问题研究》获2005年福建省第六届社会科学优秀成果奖三等奖，《海峡两岸科教创新探析》获2007年福建省第七届社会科学优秀成果奖三等奖，《依靠科技进步，推进海峡西岸经济区建设的研究》 获2005年福建省重点课题优秀调研成果二等奖。

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1、《福建科技发展报告（2002）》，福建科学技术出版社，ISBN 7-5335-2221-4/Z．80，2003.8.(第一执笔人)
2、《福建科技发展报告（2003）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 7-80691-046-8/G．19，2004.5.(第一执笔人)
3、《福建科技发展报告（2004）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 7-80691-183-9/G．82，2005.5.(第一执笔人)
4、《福建科技发展报告（2005），海潮摄影艺术出版社，ISBN 7-80691-226-6/G．88 ，2005.12.(第一执笔人)
5、《自主创新 支撑发展》，福州：海风出版社。ISBN 7-80597-570-1/Z.74,  2005.12. (参与撰写)
6、《海峡两岸科教创新探析》，人民出版社，ISBN 7-01-005766-4，2006.11，（撰稿人排名第二）。
7、《福建科技发展报告（2006）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 7-80691-280-0/G．96 ，2006.12. (第一执笔人)
8、《海峡西岸经济区热点研究》，社会科学文献出版社， ISBN 7-80230-254-4/F.051. 2006.9，（参与撰写）。
9、《福建科技发展报告（2007）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 978-7-80691-353-6/G．107 ，2007.12.(第一执笔人)
10、《福建科技发展报告（2008）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 978-7-80691-474-8/G．127 ，2008.12.(第一执笔人).
11、《福建科技发展报告（2009）》，海潮摄影艺术出版社，ISBN 978-7-80691-563-9 ，2009.12.(第一执笔人).
12、《福建科技发展报告（2010）》，海峡出版发行集团-海峡书局，ISBN 978-7-80691-648-3 ，2010.12.(第一执笔人).
13、《福建科普资源共建共享发展报告(2010)》. 海峡出版发行集团-福建科学技术出版社，ISBN 978-7-5335-3922-1.2011年6月.（第二、第三部分执笔）。
14、《福建科技发展报告（2011）》，海峡出版发行集团-海峡书局， 2012.(第一执笔人).
15、《福建省科技创新能力的监测与评价（2012）》，福建科学技术出版社，2013(第一执笔人).
16、《福建省科技创新能力的监测与评价（2013）》，福建科学技术出版社，2014(第一执笔人).
17、《福建省科技创新能力的监测与评价（2014）》，福建科学技术出版社，2015(第一执笔人).
18、《福建省科技创新能力的监测与评价（2015）》，福建科学技术出版社，2017(第一执笔人).